MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 8378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021723	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021723	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021723	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021723	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021723	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021723	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021723	AT	3	6	2873	2878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021723	TAGGC	2	10	2930	2939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021723	G	6	6	2999	3004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021723	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021723	TAAT	2	8	3078	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021723	TGG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021723	GAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021723	GAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021723	AG	3	6	9183	9188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021723	AGT	2	6	10473	10478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021723	TTA	2	6	10538	10543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021723	AGG	2	6	10583	10588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021723	AGG	2	6	11592	11597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021723	T	7	7	11887	11893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021723	AT	3	6	12668	12673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021723	AATG	2	8	12726	12733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021723	AT	3	6	12849	12854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021723	AGT	2	6	12863	12868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021723	TA	3	6	12903	12908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021723	ATTTG	2	10	12912	12921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021723	AGG	2	6	12942	12947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021723	AGG	2	6	15510	15515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021723	A	6	6	15742	15747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021723	CTAA	2	8	15753	15760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021723	CA	3	6	15783	15788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021723	ACA	2	6	16167	16172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021723	TTC	2	6	16211	16216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021723	AAGA	2	8	16221	16228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021723	GTA	2	6	16238	16243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021723	TGA	2	6	16256	16261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021723	ATT	2	6	16271	16276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021723	TTG	2	6	16539	16544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021723	AGCAG	2	10	16651	16660	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021723	ATG	2	6	16740	16745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021723	ATT	2	6	16775	16780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021723	ATG	2	6	16781	16786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021723	AAT	2	6	16922	16927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021723	CAA	2	6	16936	16941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021723	TTC	2	6	16951	16956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021723	T	7	7	16982	16988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021723	T	7	7	17029	17035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021723	AT	3	6	17768	17773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021723	AATA	2	8	17797	17804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021723	ATG	2	6	18015	18020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021723	TGA	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021723	ATG	3	9	19053	19061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021723	ATC	2	6	19185	19190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021723	TTTC	2	8	20915	20922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021723	T	6	6	20957	20962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021723	TCT	2	6	21067	21072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021723	AAT	2	6	21074	21079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021723	ATC	2	6	21086	21091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021723	AT	3	6	21111	21116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021723	GGC	2	6	21137	21142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021723	AAT	3	9	21167	21175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021723	AAC	2	6	21194	21199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021723	CTG	2	6	21242	21247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021723	CAA	2	6	21277	21282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021723	ATG	2	6	21347	21352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021723	CAA	2	6	21355	21360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021723	ATT	2	6	21393	21398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021723	AGG	2	6	23846	23851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021723	A	6	6	23922	23927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021723	TTAT	2	8	23967	23974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021723	GGGT	2	8	24027	24034	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021723	TTAA	3	12	25305	25316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021723	CCT	2	6	28783	28788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021723	GTT	2	6	28837	28842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021723	TAA	2	6	28847	28852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021723	TGT	2	6	28901	28906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021723	GCG	2	6	30354	30359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021723	A	7	7	30379	30385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021723	T	6	6	30432	30437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021723	TCA	2	6	30452	30457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021723	GCA	2	6	30467	30472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021723	TGC	2	6	31272	31277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021723	TCA	2	6	31374	31379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021723	AAG	2	6	31420	31425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021723	AT	3	6	32056	32061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021723	AT	3	6	32069	32074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021723	TGA	2	6	32107	32112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021723	ATC	2	6	32126	32131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021723	T	6	6	32142	32147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021723	TAAAGG	2	12	32282	32293	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021723	GAT	2	6	33320	33325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021723	AG	3	6	33358	33363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021723	A	6	6	34990	34995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021723	TCA	2	6	35024	35029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021723	TCT	2	6	35085	35090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021723	CGA	2	6	35771	35776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021723	AGA	2	6	35833	35838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021723	T	7	7	35904	35910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021723	GTTT	2	8	35915	35922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021723	TA	3	6	35980	35985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021723	TTAAT	2	10	35992	36001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021723	AAT	2	6	36107	36112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021723	GGA	2	6	36117	36122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021723	TTATAT	2	12	36131	36142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021723	T	6	6	36169	36174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021723	A	6	6	36207	36212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021723	TGA	2	6	36284	36289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021723	ATG	2	6	36333	36338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021723	TTTTC	2	10	36373	36382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021723	CTT	3	9	36417	36425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021723	TCC	2	6	36445	36450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021723	GAA	2	6	36477	36482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021723	TCA	2	6	36496	36501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021723	TAT	2	6	36576	36581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021723	TGC	3	9	36635	36643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021723	TCT	2	6	36649	36654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021723	TGT	2	6	36712	36717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021723	AAGT	2	8	36723	36730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021723	TGT	2	6	36816	36821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021723	TCG	2	6	36823	36828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021723	AG	4	8	36943	36950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021723	TGA	2	6	36958	36963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021723	AAC	2	6	37012	37017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021723	A	6	6	37034	37039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021723	T	6	6	37097	37102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021723	AAGGA	2	10	37124	37133	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021723	TA	3	6	37152	37157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021723	TGGG	2	8	37182	37189	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021723	ATT	2	6	37200	37205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021723	AAG	2	6	37243	37248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021723	AGAA	2	8	37281	37288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021723	TA	3	6	37623	37628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021723	T	6	6	37667	37672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021723	TTG	2	6	37688	37693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021723	T	6	6	37700	37705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021723	A	7	7	37740	37746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021723	CAA	2	6	37753	37758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021723	TCGGT	2	10	37766	37775	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021723	GGT	2	6	37814	37819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021723	ACC	2	6	38065	38070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021723	ATT	2	6	38073	38078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021723	GCT	2	6	38079	38084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021723	AGT	2	6	38228	38233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021723	CAA	2	6	38240	38245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021723	T	7	7	38333	38339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021723	TTG	2	6	38360	38365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_021723	A	6	6	41635	41640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021723	T	7	7	41647	41653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021723	AGC	2	6	41665	41670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_021723	A	7	7	90857	90863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021723	ACC	2	6	90910	90915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_021723	AAT	2	6	90943	90948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021723	ATC	2	6	91081	91086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_021723	CT	3	6	91117	91122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
297	NC_021723	GC	3	6	91125	91130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
298	NC_021723	TGATCT	2	12	91135	91146	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
299	NC_021723	TGAT	2	8	91181	91188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021723	TG	3	6	93182	93187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
301	NC_021723	CAA	2	6	93229	93234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_021723	TGG	2	6	93260	93265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
303	NC_021723	ATCAT	2	10	94694	94703	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
304	NC_021723	GCTT	2	8	94793	94800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
305	NC_021723	AAT	2	6	94874	94879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_021723	CAAGC	2	10	95258	95267	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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314	NC_021723	AGCC	2	8	95487	95494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
315	NC_021723	TAC	2	6	95655	95660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
316	NC_021723	TGA	2	6	95672	95677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_021723	GTAA	2	8	95873	95880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_021723	T	6	6	96624	96629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_021723	ATCA	2	8	98516	98523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
323	NC_021723	TCC	2	6	101754	101759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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325	NC_021723	CAAA	2	8	101816	101823	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
326	NC_021723	CAC	2	6	101966	101971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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330	NC_021723	TGG	2	6	102442	102447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
331	NC_021723	TTC	2	6	102466	102471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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334	NC_021723	TTA	2	6	102588	102593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_021723	A	6	6	102609	102614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_021723	TGG	2	6	102631	102636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_021723	TGA	2	6	106458	106463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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345	NC_021723	TTG	2	6	106965	106970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_021723	TTCG	2	8	132569	132576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
414	NC_021723	ATT	2	6	132604	132609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_021723	TCA	2	6	132629	132634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_021723	A	6	6	134344	134349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_021723	CCCAA	2	10	134367	134376	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
420	NC_021723	ATT	2	6	134440	134445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_021723	AAT	2	6	136842	136847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_021723	T	6	6	136879	136884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_021723	AT	3	6	136900	136905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_021723	ATT	2	6	137006	137011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_021723	CGG	2	6	138180	138185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_021723	GGA	2	6	138195	138200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
428	NC_021723	GCT	2	6	140115	140120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_021723	GAA	2	6	140125	140130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_021723	AGCA	2	8	140141	140148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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432	NC_021723	GCT	2	6	140202	140207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_021723	TA	3	6	140262	140267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_021723	AGG	2	6	140376	140381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_021723	TA	3	6	143568	143573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_021723	AT	3	6	143902	143907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_021723	GGA	2	6	143927	143932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_021723	TTC	2	6	144114	144119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_021723	CAT	3	9	144281	144289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_021723	ATA	2	6	144321	144326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_021723	TCC	2	6	144359	144364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_021723	AAT	2	6	144368	144373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_021723	TTC	2	6	144801	144806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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